Exome-wide association study reveals novel psoriasis susceptibility locus at TNFSF15 and rare protective alleles in genes contributing to type I IFN signalling [Elektronisk resurs]
-
Dand, Nick (författare)
-
Mucha, Soeren (författare)
-
Tsoi, Lam C. (författare)
-
Mahil, Satveer K. (författare)
-
Stuart, Philip E. (författare)
-
Arnold, Andreas (författare)
-
Baurecht, Hansjoerg (författare)
-
David Burden, A. (författare)
-
Callis Duffin, Kristina (författare)
-
Chandran, Vinod (författare)
-
Curtis, Charles J. (författare)
-
Das, Sayantan (författare)
-
Ellinghaus, David (författare)
-
Ellinghaus, Eva (författare)
-
Enerbäck, Charlotta (författare)
-
Esko, Tonu (författare)
-
Gladman, Dafna D. (författare)
-
Griffiths, Christopher E. M. (författare)
-
Gudjonsson, Johann E. (författare)
-
Hoffman, Per (författare)
-
Homuth, Georg (författare)
-
Hueffmeier, Ulrike (författare)
-
Krueger, Gerald G. (författare)
-
Laudes, Matthias (författare)
-
Hyuck Lee, Sang (författare)
-
Lieb, Wolfgang (författare)
-
Lim, Henry W. (författare)
-
Loehr, Sabine (författare)
-
Mrowietz, Ulrich (författare)
-
Mueller-Nurayid, Martina (författare)
-
Noethen, Markus (författare)
-
Peters, Annette (författare)
-
Rahman, Proton (författare)
-
Reis, Andre (författare)
-
Reynolds, Nick J. (författare)
-
Rodriguez, Elke (författare)
-
Schmidt, Carsten O. (författare)
-
Spain, Sarah L. (författare)
-
Strauch, Konstantin (författare)
-
Tejasvi, Trilokraj (författare)
-
Voorhees, John J. (författare)
-
Warren, Richard B. (författare)
-
Weichenthal, Michael (författare)
-
Weidinger, Stephan (författare)
-
Zawistowski, Matthew (författare)
-
Nair, Rajan P. (författare)
-
Capon, Francesca (författare)
-
Smith, Catherine H. (författare)
-
Trembath, Richard C. (författare)
-
Abecasis, Goncalo R. (författare)
-
Elder, James T. (författare)
-
Franke, Andre (författare)
-
Simpson, Michael A. (författare)
-
Barker, Jonathan N. (författare)
-
- Linköpings universitet Institutionen för klinisk och experimentell medicin (utgivare)
-
-
Alternativt namn: IKE
-
Alternativt namn: Linköping University. Department of Clinical and Experimental Medicine
-
Alternativt namn: Linköping University. Faculty of Health Sciences. Department of Clinical and Experimental Medicine
-
Linköpings universitet Medicinska fakulteten (utgivare)
-
Region Östergötland Hjärt- och Medicincentrum (utgivare)
- OXFORD UNIV PRESS 2017
- Engelska.
-
Ingår i: Human Molecular Genetics. - 0964-6906. ; 26:21, 4301-4313
-
Läs hela texten
-
Läs hela texten
-
Läs hela texten
Sammanfattning
Ämnesord
Stäng
- Psoriasis is a common inflammatory skin disorder for which multiple genetic susceptibility loci have been identified, but few resolved to specific functional variants. In this study, we sought to identify common and rare psoriasis-associated gene-centric variation. Using exome arrays we genotyped four independent cohorts, totalling 11 861 psoriasis cases and 28 610 controls, aggregating the dataset through statistical meta-analysis. Single variant analysis detected a previously unreported risk locus at TNFSF15 (rs6478108; P = 1.50 x 10(-8), OR = 1.10), and association of common protein-altering variants at 11 loci previously implicated in psoriasis susceptibility. We validate previous reports of protective low-frequency protein-altering variants within IFIH1 (encoding an innate antiviral receptor) and TYK2 (encoding a Janus kinase), in each case establishing a further series of protective rare variants (minor allele frequency amp;lt; 0.01) via gene-wide aggregation testing (IFIH1: p(burden) = 2.53 x 10(-7), OR = 0.707; TYK2: p(burden) = 6.17 x 10(-4), OR = 0.744). Both genes play significant roles in type I interferon (IFN) production and signalling. Several of the protective rare and low-frequency variants in IFIH1 and TYK2 disrupt conserved protein domains, highlighting potential mechanisms through which their effect may be exerted.
Ämnesord
- Medical and Health Sciences (hsv)
- Basic Medicine (hsv)
- Medical Genetics (hsv)
- Medicin och hälsovetenskap (hsv)
- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv)
- Medicinsk genetik (hsv)
Inställningar
Hjälp
Beståndsinformation saknas