Startsida
Hjälp
Sök i LIBRIS databas

     

 

Sökning: onr:gv190lh6dr8xz66v > RAG1 co-expression ...

RAG1 co-expression signature identifies ETV6-RUNX1-like B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia in children [Elektronisk resurs]

Chen, Dongfeng (författare)
Camponeschi, Alessandro (författare)
Nordlund, Jessica (författare)
Marincevic-Zuniga, Yanara (författare)
Abrahamsson, Jonas (författare)
Lönnerholm, Gudmar, 1941- (författare)
Fogelstrand, Linda (författare)
Mårtensson, Inga-Lill (författare)
barnonkologisk forskning - särskilt fokus på komplikationer (medarbetare)
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
Uppsala universitet Science for Life Laboratory, SciLifeLab (utgivare)
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
Publicerad: WILEY, 2021
Engelska.
Ingår i: Cancer Medicine. - 2045-7634. ; 10:12, 3997-4003
Läs hela texten
Läs hela texten
Läs hela texten
  • E-artikel/E-kapitel
Sammanfattning Ämnesord
Stäng  
  • B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (BCP-ALL) can be classified into subtypes according to the genetic aberrations they display. For instance, the translocation t(12;21)(p13;q22), representing the ETV6-RUNX1 fusion gene (ER), is present in a quarter of BCP-ALL cases. However, around 10% of the cases lack classifying chromosomal abnormalities (B-other). In pediatric ER BCP-ALL, rearrangement mediated by RAG (recombination-activating genes) has been proposed as the predominant driver of oncogenic rearrangement. Herein we analyzed almost 1600 pediatric BCP-ALL samples to determine which subtypes express RAG. We demonstrate that RAG1 mRNA levels are especially high in the ETV6-RUNX1 (ER) subtype and in a subset of B-other samples. We also define 31 genes that are co-expressed with RAG1 (RAG1-signature) in the ER subtype, a signature that also identifies this subset of B-other samples. Moreover, this subset also shares leukemia and pro-B gene expression signatures as well as high levels of the ETV6 target genes (BIRC7, WBP1L, CLIC5, ANGPTL2) with the ER subtype, indicating that these B-other cases are the recently identified ER-like subtype. We validated our results in a cohort where ER-like has been defined, which confirmed expression of the RAG1-signature in this recently described subtype. Taken together, our results demonstrate that the RAG1-signature identifies the ER-like subtype. As there are no definitive genetic markers to identify this novel subtype, the RAG1-signature represents a means to screen for this leukemia in children. 

Ämnesord

Medical and Health Sciences  (hsv)
Clinical Medicine  (hsv)
Hematology  (hsv)
Medicin och hälsovetenskap  (hsv)
Klinisk medicin  (hsv)
Hematologi  (hsv)
Medical and Health Sciences  (hsv)
Clinical Medicine  (hsv)
Cancer and Oncology  (hsv)
Medicin och hälsovetenskap  (hsv)
Klinisk medicin  (hsv)
Cancer och onkologi  (hsv)

Genre

government publication  (marcgt)

Indexterm och SAB-rubrik

BCP&#8208
ALL
ETV6&#8208
RUNX1
RUNX1&#8208
like
leukemia
RAG1
Inställningar Hjälp

Ingår i annan publikation. Gå till titeln Cancer Medicine

Om LIBRIS
Sekretess
Hjälp
Fel i posten?
Kontakt
Teknik och format
Sök utifrån
Sökrutor
Plug-ins
Bookmarklet
Anpassa
Textstorlek
Kontrast
Vyer
LIBRIS söktjänster
SwePub
Uppsök

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy