Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes [Elektronisk resurs]
-
Rheinbay, Esther (författare)
-
Nielsen, Morten Muhlig (författare)
-
Abascal, Federico (författare)
-
Wala, Jeremiah A. (författare)
-
Shapira, Ofer (författare)
-
Tiao, Grace (författare)
-
Hornshoj, Henrik (författare)
-
Hess, Julian M. (författare)
-
Juul, Randi Istrup (författare)
-
Lin, Ziao (författare)
-
Feuerbach, Lars (författare)
-
Sabarinathan, Radhakrishnan (författare)
-
Madsen, Tobias (författare)
-
Kim, Jaegil (författare)
-
Mularoni, Loris (författare)
-
Shuai, Shimin (författare)
-
Lanzos, Andres (författare)
-
Herrmann, Carl (författare)
-
Maruvka, Yosef E. (författare)
-
Shen, Ciyue (författare)
-
Amin, Samirkumar B. (författare)
-
Bandopadhayay, Pratiti (författare)
-
Bertl, Johanna (författare)
-
Boroevich, Keith A. (författare)
-
Busanovich, John (författare)
-
Carlevaro-Fita, Joana (författare)
-
Chakravarty, Dimple (författare)
-
Chan, Calvin Wing Yiu (författare)
-
Craft, David (författare)
-
Dhingra, Priyanka (författare)
-
Diamanti, Klev, 1987- (författare)
-
Fonseca, Nuno A. (författare)
-
Gonzalez-Perez, Abel (författare)
-
Guo, Qianyun (författare)
-
Hamilton, Mark P. (författare)
-
Haradhvala, Nicholas J. (författare)
-
Hong, Chen (författare)
-
Isaev, Keren (författare)
-
Johnson, Todd A. (författare)
-
Juul, Malene (författare)
-
Kahles, Andre (författare)
-
Kahraman, Abdullah (författare)
-
Kim, Youngwook (författare)
-
Komorowski, Jan (författare)
-
Kumar, Kiran (författare)
-
Kumar, Sushant (författare)
-
Lee, Donghoon (författare)
-
Lehmann, Kjong-Van (författare)
-
Li, Yilong (författare)
-
Liu, Eric Minwei (författare)
-
Lochovsky, Lucas (författare)
-
Park, Keunchil (författare)
-
Pich, Oriol (författare)
-
Roberts, Nicola D. (författare)
-
Saksena, Gordon (författare)
-
Schumacher, Steven E. (författare)
-
Sidiropoulos, Nikos (författare)
-
Sieverling, Lina (författare)
-
Sinnott-Armstrong, Nasa (författare)
-
Stewart, Chip (författare)
-
Tamborero, David (författare)
-
Tubio, Jose M. C. (författare)
-
Umer, Husen Muhammad (författare)
-
Uuskula-Reimand, Liis (författare)
-
Wadelius, Claes, 1955- (författare)
-
Wadi, Lina (författare)
-
Yao, Xiaotong (författare)
-
Zhang, Cheng-Zhong (författare)
-
Zhang, Jing (författare)
-
Haber, James E. (författare)
-
Hobolth, Asger (författare)
-
Imielinski, Marcin (författare)
-
Kellis, Manolis (författare)
-
Lawrence, Michael S. (författare)
-
von Mering, Christian (författare)
-
Nakagawa, Hidewaki (författare)
-
Raphael, Benjamin J. (författare)
-
Rubin, Mark A. (författare)
-
Sander, Chris (författare)
-
Stein, Lincoln D. (författare)
-
Stuart, Joshua M. (författare)
-
Tsunoda, Tatsuhiko (författare)
-
Wheeler, David A. (författare)
-
Johnson, Rory (författare)
-
Reimand, Juri (författare)
-
Gerstein, Mark (författare)
-
Khurana, Ekta (författare)
-
Campbell, Peter J. (författare)
-
Lopez-Bigas, Nuria (författare)
-
Weischenfeldt, Joachim (författare)
-
Beroukhim, Rameen (författare)
-
Martincorena, Inigo (författare)
-
Pedersen, Jakob Skou (författare)
-
Getz, Gad (författare)
-
Bader, Gary D. (författare)
-
Barenboim, Jonathan (författare)
-
Brunak, Soren (författare)
-
Chen, Ken (författare)
-
Choi, Jung Kyoon (författare)
-
Deu-Pons, Jordi (författare)
-
Fink, J. Lynn (författare)
-
Frigola, Joan (författare)
-
Gambacorti-Passerini, Carlo (författare)
-
Garsed, Dale W. (författare)
-
Gut, Ivo G. (författare)
-
Haan, David (författare)
-
Harmanci, Arif O. (författare)
-
Helmy, Mohamed (författare)
-
Hodzic, Ermin (författare)
-
Izarzugaza, Jose M. G. (författare)
-
Kim, Jong K. (författare)
-
Korbel, Jan O. (författare)
-
Larsson, Erik (författare)
-
Li, Shantao (författare)
-
Li, Xiaotong (författare)
-
Lou, Shaoke (författare)
-
Marchal, Kathleen (författare)
-
Martinez-Fundichely, Alexander (författare)
-
McGillivray, Patrick D. (författare)
-
Meyerson, William (författare)
-
Muinos, Ferran (författare)
-
Paczkowska, Marta (författare)
-
Park, Kiejung (författare)
-
Pons, Tirso (författare)
-
Pulido-Tamayo, Sergio (författare)
-
Reyes-Salazar, Iker (författare)
-
Reyna, Matthew A. (författare)
-
Rubio-Perez, Carlota (författare)
-
Sahinalp, S. Cenk (författare)
-
Salichos, Leonidas (författare)
-
Shackleton, Mark (författare)
-
Shrestha, Raunak (författare)
-
Valencia, Alfonso (författare)
-
Vazquez, Miguel (författare)
-
Verbeke, Lieven P. C. (författare)
-
Wang, Jiayin (författare)
-
Warrell, Jonathan (författare)
-
Waszak, Sebastian M. (författare)
-
Wu, Guanming (författare)
-
Yu, Jun (författare)
-
Zhang, Xuanping (författare)
-
Zhang, Yan (författare)
-
Zhao, Zhongming (författare)
-
Zou, Lihua (författare)
-
Akdemir, Kadir C. (författare)
-
Alvarez, Eva G. (författare)
-
Baez-Ortega, Adrian (författare)
-
Boutros, Paul C. (författare)
-
Bowtell, David D. L. (författare)
-
Brors, Benedikt (författare)
-
Burns, Kathleen H. (författare)
-
Chan, Kin (författare)
-
CortesCiriano, Isidro (författare)
-
Dueso-Barroso, Ana (författare)
-
Dunford, Andrew J. (författare)
-
Edwards, Paul A. (författare)
-
Estivill, Xavier (författare)
-
Etemadmoghadam, Dariush (författare)
-
Frenkel-Morgenstern, Milana (författare)
-
Gordenin, Dmitry A. (författare)
-
Hutter, Barbara (författare)
-
Jones, David T. W. (författare)
-
Ju, Young Seok (författare)
-
Kazanov, Marat D. (författare)
-
Klimczak, Leszek J. (författare)
-
Koh, Youngil (författare)
-
Lee, Eunjung Alice (författare)
-
Lee, Jake June-Koo (författare)
-
Lynch, Andy G. (författare)
-
Macintyre, Geoff (författare)
-
Markowetz, Florian (författare)
-
Meyerson, Matthew (författare)
-
Miyano, Satoru (författare)
-
Navarro, Fabio C. P. (författare)
-
Ossowski, Stephan (författare)
-
Park, Peter J. (författare)
-
Pearson, John (författare)
-
Puiggros, Montserrat (författare)
-
Rippe, Karsten (författare)
-
Roberts, Steven A. (författare)
-
RodriguezMartin, Bernardo (författare)
-
Scully, Ralph (författare)
-
Torrents, David (författare)
-
Villasante, Izar (författare)
-
Waddell, Nicola (författare)
-
Yang, Lixing (författare)
-
Yoon, Sung-Soo (författare)
-
Zamora, Jorge (författare)
-
Uppsala universitet Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet (utgivare)
-
Uppsala universitet Science for Life Laboratory, SciLifeLab (utgivare)
-
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
- Publicerad: 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Nature. - 0028-0836. ; 578:7793, 102-111
-
Läs hela texten
-
Läs hela texten
-
Läs hela texten
Sammanfattning
Ämnesord
Stäng
- The discovery of drivers of cancer has traditionally focused on protein-coding genes(1-4). Here we present analyses of driver point mutations and structural variants in non-coding regions across 2,658 genomes from the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium(5) of the International Cancer Genome Consortium (ICGC) and The Cancer Genome Atlas (TCGA). For point mutations, we developed a statistically rigorous strategy for combining significance levels from multiple methods of driver discovery that overcomes the limitations of individual methods. For structural variants, we present two methods of driver discovery, and identify regions that are significantly affected by recurrent breakpoints and recurrent somatic juxtapositions. Our analyses confirm previously reported drivers(6,7), raise doubts about others and identify novel candidates, including point mutations in the 5' region of TP53, in the 3' untranslated regions of NFKBIZ and TOB1, focal deletions in BRD4 and rearrangements in the loci of AKR1C genes. We show that although point mutations and structural variants that drive cancer are less frequent in non-coding genes and regulatory sequences than in protein-coding genes, additional examples of these drivers will be found as more cancer genomes become available.
Ämnesord
- Medical and Health Sciences (hsv)
- Basic Medicine (hsv)
- Medical Genetics (hsv)
- Medicin och hälsovetenskap (hsv)
- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv)
- Medicinsk genetik (hsv)
Genre
- government publication (marcgt)
Inställningar
Hjälp
Ingår i annan publikation. Gå till titeln
Nature