Startsida
Hjälp
Sök i LIBRIS databas

     

 

Sökning: onr:cqrnlrsw913382mn > Dense sampling of b...

Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics [Elektronisk resurs]

Feng, Shaohong (författare)
Stiller, Josefin (författare)
Deng, Yuan (författare)
Armstrong, Joel (författare)
Fang, Qi (författare)
Reeve, Andrew Hart (författare)
Xie, Duo (författare)
Chen, Guangji (författare)
Guo, Chunxue (författare)
Faircloth, Brant C. (författare)
Petersen, Bent (författare)
Wang, Zongji (författare)
Zhou, Qi (författare)
Diekhans, Mark (författare)
Chen, Wanjun (författare)
Andreu-Sanchez, Sergio (författare)
Margaryan, Ashot (författare)
Howard, Jason Travis (författare)
Parent, Carole (författare)
Pacheco, George (författare)
Sinding, Mikkel-Holger S. (författare)
Puetz, Lara (författare)
Cavill, Emily (författare)
Ribeiro, Angela M. (författare)
Eckhart, Leopold (författare)
Fjeldsa, Jon (författare)
Hosner, Peter A. (författare)
Brumfield, Robb T. (författare)
Christidis, Les (författare)
Bertelsen, Mads F. (författare)
Sicheritz-Ponten, Thomas (författare)
Tietze, Dieter Thomas (författare)
Robertson, Bruce C. (författare)
Song, Gang (författare)
Borgia, Gerald (författare)
Claramunt, Santiago (författare)
Lovette, Irby J. (författare)
Cowen, Saul J. (författare)
Njoroge, Peter (författare)
Dumbacher, John Philip (författare)
Ryder, Oliver A. (författare)
Fuchs, Jerome (författare)
Bunce, Michael (författare)
Burt, David W. (författare)
Cracraft, Joel (författare)
Meng, Guanliang (författare)
Hackett, Shannon J. (författare)
Ryan, Peter G. (författare)
Jonsson, Knud Andreas (författare)
Jamieson, Ian G. (författare)
da Fonseca, Rute R. (författare)
Braun, Edward L. (författare)
Houde, Peter (författare)
Mirarab, Siavash (författare)
Suh, Alexander (författare)
Hansson, Bengt (författare)
Ponnikas, Suvi (författare)
Sigeman, Hanna (författare)
Stervander, Martin (författare)
Frandsen, Paul B. (författare)
van der Zwan, Henriette (författare)
van der Sluis, Rencia (författare)
Visser, Carina (författare)
Balakrishnan, Christopher N. (författare)
Clark, Andrew G. (författare)
Fitzpatrick, John W. (författare)
Bowman, Reed (författare)
Chen, Nancy (författare)
Cloutier, Alison (författare)
Sackton, Timothy B. (författare)
Edwards, Scott V. (författare)
Foote, Dustin J. (författare)
Shakya, Subir B. (författare)
Sheldon, Frederick H. (författare)
Vignal, Alain (författare)
Soares, Andre E. R. (författare)
Shapiro, Beth (författare)
Gonzalez-Solis, Jacob (författare)
Ferrer-Obiol, Joan (författare)
Rozas, Julio (författare)
Riutort, Marta (författare)
Tigano, Anna (författare)
Friesen, Vicki (författare)
Dalen, Love (författare)
Urrutia, Araxi O. (författare)
Szekely, Tamas (författare)
Liu, Yang (författare)
Campana, Michael G. (författare)
Corvelo, Andre (författare)
Fleischer, Robert C. (författare)
Rutherford, Kim M. (författare)
Gemmell, Neil J. (författare)
Dussex, Nicolas (författare)
Mouritsen, Henrik (författare)
Thiele, Nadine (författare)
Delmore, Kira (författare)
Liedvogel, Miriam (författare)
Franke, Andre (författare)
Hoeppner, Marc P. (författare)
Krone, Oliver (författare)
Fudickar, Adam M. (författare)
Mila, Borja (författare)
Ketterson, Ellen D. (författare)
Fidler, Andrew Eric (författare)
Friis, Guillermo (författare)
Parody-Merino, Angela M. (författare)
Battley, Phil F. (författare)
Cox, Murray P. (författare)
Lima, Nicholas Costa Barroso (författare)
Prosdocimi, Francisco (författare)
Parchman, Thomas Lee (författare)
Schlinger, Barney A. (författare)
Loiselle, Bette A. (författare)
Blake, John G. (författare)
Lim, Haw Chuan (författare)
Day, Lainy B. (författare)
Fuxjager, Matthew J. (författare)
Baldwin, Maude W. (författare)
Braun, Michael J. (författare)
Wirthlin, Morgan (författare)
Dikow, Rebecca B. (författare)
Ryder, T. Brandt (författare)
Camenisch, Glauco (författare)
Keller, Lukas F. (författare)
DaCosta, Jeffrey M. (författare)
Hauber, Mark E. (författare)
Louder, Matthew I. M. (författare)
Witt, Christopher C. (författare)
McGuire, Jimmy A. (författare)
Mudge, Joann (författare)
Megna, Libby C. (författare)
Carling, Matthew D. (författare)
Wang, Biao (författare)
Taylor, Scott A. (författare)
Del-Rio, Glaucia (författare)
Aleixo, Alexandre (författare)
Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro (författare)
Mello, Claudio V. (författare)
Weir, Jason T. (författare)
Haussler, David (författare)
Li, Qiye (författare)
Yang, Huanming (författare)
Wang, Jian (författare)
Lei, Fumin (författare)
Rahbek, Carsten (författare)
Gilbert, M. Thomas P. (författare)
Graves, Gary R. (författare)
Jarvis, Erich D. (författare)
Paten, Benedict (författare)
Zhang, Guojie (författare)
Uppsala universitet Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet (utgivare)
Uppsala universitet Science for Life Laboratory, SciLifeLab (utgivare)
Uppsala universitet Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet (utgivare)
Publicerad: NATURE RESEARCH, 2020
Engelska.
Ingår i: Nature. - 0028-0836. ; 587:7833, 252-257
Läs hela texten
Läs hela texten
Läs hela texten
  • E-artikel/E-kapitel
Sammanfattning Ämnesord
Stäng  
  • Whole-genome sequencing projects are increasingly populating the tree of life and characterizing biodiversity(1-4). Sparse taxon sampling has previously been proposed to confound phylogenetic inference(5), and captures only a fraction of the genomic diversity. Here we report a substantial step towards the dense representation of avian phylogenetic and molecular diversity, by analysing 363 genomes from 92.4% of bird families-including 267 newly sequenced genomes produced for phase II of the Bird 10,000 Genomes (B10K) Project. We use this comparative genome dataset in combination with a pipeline that leverages a reference-free whole-genome alignment to identify orthologous regions in greater numbers than has previously been possible and to recognize genomic novelties in particular bird lineages. The densely sampled alignment provides a single-base-pair map of selection, has more than doubled the fraction of bases that are confidently predicted to be under conservation and reveals extensive patterns of weak selection in predominantly non-coding DNA. Our results demonstrate that increasing the diversity of genomes used in comparative studies can reveal more shared and lineage-specific variation, and improve the investigation of genomic characteristics. We anticipate that this genomic resource will offer new perspectives on evolutionary processes in cross-species comparative analyses and assist in efforts to conserve species. A dataset of the genomes of 363 species from the Bird 10,000 Genomes Project shows increased power to detect shared and lineage-specific variation, demonstrating the importance of phylogenetically diverse taxon sampling in whole-genome sequencing. 

Ämnesord

Natural Sciences  (hsv)
Biological Sciences  (hsv)
Evolutionary Biology  (hsv)
Naturvetenskap  (hsv)
Biologiska vetenskaper  (hsv)
Evolutionsbiologi  (hsv)
Natural Sciences  (hsv)
Biological Sciences  (hsv)
Genetics  (hsv)
Naturvetenskap  (hsv)
Biologiska vetenskaper  (hsv)
Genetik  (hsv)

Genre

government publication  (marcgt)
Inställningar Hjälp

Ingår i annan publikation. Gå till titeln Nature

Sök vidare

Hjälp
Fler titlar av
Feng, Shaohong
Stiller, Josefin
Deng, Yuan
Armstrong, Joel
Fang, Qi
Reeve, Andrew Hart
visa fler...
Xie, Duo
Chen, Guangji
Guo, Chunxue
Faircloth, Brant C.
Petersen, Bent
Wang, Zongji
Zhou, Qi
Diekhans, Mark
Chen, Wanjun
Andreu-Sanchez, Serg ...
Margaryan, Ashot
Howard, Jason Travis
Parent, Carole
Pacheco, George
Sinding, Mikkel-Holg ...
Puetz, Lara
Cavill, Emily
Ribeiro, Angela M.
Eckhart, Leopold
Fjeldsa, Jon
Hosner, Peter A.
Brumfield, Robb T.
Christidis, Les
Bertelsen, Mads F.
Sicheritz-Ponten, Th ...
Tietze, Dieter Thoma ...
Robertson, Bruce C.
Song, Gang
Borgia, Gerald
Claramunt, Santiago
Lovette, Irby J.
Cowen, Saul J.
Njoroge, Peter
Dumbacher, John Phil ...
Ryder, Oliver A.
Fuchs, Jerome
Bunce, Michael
Burt, David W.
Cracraft, Joel
Meng, Guanliang
Hackett, Shannon J.
Ryan, Peter G.
Jonsson, Knud Andrea ...
Jamieson, Ian G.
da Fonseca, Rute R.
Braun, Edward L.
Houde, Peter
Mirarab, Siavash
Suh, Alexander
Hansson, Bengt
Ponnikas, Suvi
Sigeman, Hanna
Stervander, Martin
Frandsen, Paul B.
van der Zwan, Henrie ...
van der Sluis, Renci ...
Visser, Carina
Balakrishnan, Christ ...
Clark, Andrew G.
Fitzpatrick, John W.
Bowman, Reed
Chen, Nancy
Cloutier, Alison
Sackton, Timothy B.
Edwards, Scott V.
Foote, Dustin J.
Shakya, Subir B.
Sheldon, Frederick H ...
Vignal, Alain
Soares, Andre E. R.
Shapiro, Beth
Gonzalez-Solis, Jaco ...
Ferrer-Obiol, Joan
Rozas, Julio
Riutort, Marta
Tigano, Anna
Friesen, Vicki
Dalen, Love
Urrutia, Araxi O.
Szekely, Tamas
Liu, Yang
Campana, Michael G.
Corvelo, Andre
Fleischer, Robert C.
Rutherford, Kim M.
Gemmell, Neil J.
Dussex, Nicolas
Mouritsen, Henrik
Thiele, Nadine
Delmore, Kira
Liedvogel, Miriam
Franke, Andre
Hoeppner, Marc P.
Krone, Oliver
Fudickar, Adam M.
Mila, Borja
Ketterson, Ellen D.
Fidler, Andrew Eric
Friis, Guillermo
Parody-Merino, Angel ...
Battley, Phil F.
Cox, Murray P.
Lima, Nicholas Costa ...
Prosdocimi, Francisc ...
Parchman, Thomas Lee
Schlinger, Barney A.
Loiselle, Bette A.
Blake, John G.
Lim, Haw Chuan
Day, Lainy B.
Fuxjager, Matthew J.
Baldwin, Maude W.
Braun, Michael J.
Wirthlin, Morgan
Dikow, Rebecca B.
Ryder, T. Brandt
Camenisch, Glauco
Keller, Lukas F.
DaCosta, Jeffrey M.
Hauber, Mark E.
Louder, Matthew I. M ...
Witt, Christopher C.
McGuire, Jimmy A.
Mudge, Joann
Megna, Libby C.
Carling, Matthew D.
Wang, Biao
Taylor, Scott A.
Del-Rio, Glaucia
Aleixo, Alexandre
Vasconcelos, Ana Ter ...
Mello, Claudio V.
Weir, Jason T.
Haussler, David
Li, Qiye
Yang, Huanming
Wang, Jian
Lei, Fumin
Rahbek, Carsten
Gilbert, M. Thomas P ...
Graves, Gary R.
Jarvis, Erich D.
Paten, Benedict
Zhang, Guojie
Uppsala universitet ...
Uppsala universitet ...
visa färre...
Fler titlar om
Natural Sciences
Biological Sciences
Evolutionary Biology
Naturvetenskap
Biologiska vetenskap ...
Evolutionsbiologi
visa fler...
Genetics
Genetik
visa färre...
Fler titlar i denna genre
government publicati ...
channel record
Fler delar
Ingår i
Nature
Fler artiklar

Sök utanför LIBRIS

Hjälp
Om LIBRIS
Sekretess
Hjälp
Fel i posten?
Kontakt
Teknik och format
Sök utifrån
Sökrutor
Plug-ins
Bookmarklet
Anpassa
Textstorlek
Kontrast
Vyer
LIBRIS söktjänster
SwePub
Uppsök

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy