Transcriptomic analysis reveals proinflammatory signatures associated with acute myeloid leukemia progression [Elektronisk resurs]
-
Stratmann, Svea, 1989- (författare)
-
Yones, Sara A. (författare)
-
Garbulowski, Mateusz (författare)
-
Sun, Jitong (författare)
-
Skaftason, Aron (författare)
-
Mayrhofer, Markus, 1981- (författare)
-
Norgren, Nina (författare)
-
Krogh Herlin, Morten (författare)
-
Sundström, Christer (författare)
-
Eriksson, Anna, 1977- (författare)
-
Höglund, Martin (författare)
-
Palle, Josefine, 1964- (författare)
-
Abrahamsson, Jonas (författare)
-
Jahnukainen, Kirsi (författare)
-
Cheng Munthe-Kaas, Monica (författare)
-
Zeller, Bernward (författare)
-
Pokrovskaja Tamm, Katja (författare)
-
Cavelier, Lucia (författare)
-
Komorowski, Jan (författare)
-
Holmfeldt, Linda (författare)
-
Linda Holmfeldt (medarbetare)
-
Holmfeldt (medarbetare)
-
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
-
Uppsala universitet Science for Life Laboratory, SciLifeLab (utgivare)
-
Uppsala universitet Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet (utgivare)
-
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
-
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
-
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
-
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
-
Uppsala universitet Kollegiet för avancerade studier (SCAS) (utgivare)
-
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
-
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
- Publicerad: 2022
- Engelska.
-
Ingår i: Blood Advances. - 2473-9529. ; 6:1, 152-164
-
Läs hela texten
-
Läs hela texten
-
Läs hela texten
Sammanfattning
Ämnesord
Stäng
- Numerous studies have been performed over the last decade to exploit the complexity of genomic and transcriptomic lesions driving the initiation of acute myeloid leukemia (AML). These studies have helped improve risk classification and treatment options. Detailed molecular characterization of longitudinal AML samples is sparse, however; meanwhile, relapse and therapy resistance represent the main challenges in AML care. To this end, we performed transcriptome-wide RNA sequencing of longitudinal diagnosis, relapse, and/or primary resistant samples from 47 adult and 23 pediatric AML patients with known mutational background. Gene expression analysis revealed the association of short event-free survival with overexpression of GLI2 and IL1R1, as well as downregulation of ST18 . Moreover, CR1 downregulation and DPEP1 upregulation were associated with AML relapse both in adults and children. Finally, machine learning–based and network-based analysis identified overexpressed CD6 and downregulated INSR as highly copredictive genes depicting important relapse-associated characteristics among adult patients with AML. Our findings highlight the importance of a tumor-promoting inflammatory environment in leukemia progression, as indicated by several of the herein identified differentially expressed genes. Together, this knowledge provides the foundation for novel personalized drug targets and has the potential to maximize the benefit of current treatments to improve cure rates in AML.
Ämnesord
- Medical and Health Sciences (hsv)
- Clinical Medicine (hsv)
- Cancer and Oncology (hsv)
- Medicin och hälsovetenskap (hsv)
- Klinisk medicin (hsv)
- Cancer och onkologi (hsv)
- Medical and Health Sciences (hsv)
- Clinical Medicine (hsv)
- Hematology (hsv)
- Medicin och hälsovetenskap (hsv)
- Klinisk medicin (hsv)
- Hematologi (hsv)
- Medicinsk vetenskap (uu)
- Medical Science (uu)
Genre
- government publication (marcgt)
Indexterm och SAB-rubrik
- Acute myeloid leukemia
- RNA-sequencing
- relapse and resistance
- machine learning-based analysis
Inställningar
Hjälp
Ingår i annan publikation. Gå till titeln
Blood Advances